Regionsrådet i Region Nordjylland nedsatte i april 2010 en projektorganisation til at varetage alle opgaver i forbindelse med Nyt Aalborg Universitetshospital.
Herudover varetager organisationen også større anlægsopgaver på Aalborg Universitetshospital frem til ibrugtagningen af det nye universitetshospital for at sikre sammenhæng mellem nybyggeriet og anvendelsen af de eksisterende bygninger.
Projektorganisationen består af en politisk og en administrativ del.
Projektorganisation efterår 2014

Forretningsudvalg
Forretningsudvalget udgør byggeudvalget for det kommende universitetshospital i Aalborg Øst.
Følgegruppe
I perioden 2018-2021 sidder regionsrådsformand Ulla Astman (A), 1. næstformand Lone Sondrup (V), 2. næstformand Lene Linneman (SF), Jess Vibech Laursen (V), Jette Ramskov Christensen (A), i politisk følgegruppe
Følgegruppen skal på vegne af Forretningsudvalget og Regionsrådet følge etableringen af Nyt Universitetssygehus Aalborg. Følgegruppen mødes ca. 1 gang om måneden, idet mødefrekvensen løbende aftales i følgegruppen under hensyn til projektets aktuelle stade.
Direktionen deltager i følgegruppens møder. Sager vil blive forelagt den politiske følgegruppe forinden behandling i Forretningsudvalg og Regionsråd.
Direktionen i Region Nordjylland
Direktionen fungerer som administrativ styregruppe for Nyt Universitetshospital Aalborg. Projektdirektøren for Nyt Aalborg Universitetshospital deltager en gang månedligt i direktionens møder.
Projektledelse Nyt Aalborg Universitetshospital
Projektledelsen udgøres af Niels Uhrenfeldt, projektdirektør for Nyt Aalborg Universitetshospital og Jens Ole Skov, direktør for Aalborg Universitetshospital. Projektledelsen refererer til Direktionen.
Projektafdelingen
Projektafdelingen ledes af projektdirektøren for Nyt Universitetshospital Aalborg. Projektdirektøren har ansvaret for at sikre sammenhæng i bl.a. finansiering, fysisk planlægning (byggeprogram, projektforslag mv.), udbud og gennemførelse af byggeri.
Rådgivere m.fl.
Konsortium Indigo er antaget som totalrådgiver og Niras som byggeledelse. Der vil i forbindelse med projektets planlægning og gennemførelse være behov for en række forskellige former for rådgivningsbistand (teknisk, juridisk, finansielt m.v.)
Arbejdsgrupper
I løbet af projektet vil der løbende blive nedsat arbejdsgrupper, der varetager udredningen af de enkelte elementer i relation til projektforslag både indenfor det kliniske område samt servicefunktionerne. Arbejdsgrupperne vil kunne variere meget i antal og karakter gennem forløbet. De enkelte arbejdsgruppers sammensætning bliver præciseret med repræsentanter for alle relevante interessenter for det konkrete område.
Stabsfunktioner i Region Nordjylland
På grund af sin størrelse og kompleksitet må projektet forventes at få afsmittende virkning på den øvrige del af Regionens virksomhed. Projektafdelingen har ansvaret for at koordinere de forskellige dele og at sikre den fornødne medinddragelse fra relevante afdelinger i sin opgaveløsning. Det betyder, at hele regionens organisation i fornødent omfang bidrager til projektet.